הסדרה "הספינה האחרונה" מגוללת את סיפורם של צוות משחתת אמריקאית, בעולם שבו התרחש אסון גלובלי אשר הביא למותם של כל בני האדם, מלבד אותה משחתת אמריקאית. צוות הספינה מבין שלא נותר להם ברירה ושהם חייבים להתמודד עם המציאות החדשה של קיומם בעולם שבו הם עשויים להיות הניצולים היחידיים.