וינה, 1824. יום לפני הפרמיירה של הסימפוניה התשיעית של בטהובן, והתפקידים של הנגנים עדיין אינם כתובים. המוציא לאור המוזיקאלי של הסימפוניה, וונזל שלמר (ראלף ריאך), זקוק בדחיפות למעתיק (אדם הכותב את התווים השונים של הכלים השונים מהיצירה המקורית של המלחין) כדי לסיים את העבודה. אנה הולץ (דיאן קרוגר) היא מלחינה צעירה בת 23, שאפתנית, אך חסרת אמצעים, המחפשת השראה וקידום לקריירה שלה בבירת המוזיקה העולמית - וינה. כסטודנטית בקונסרבטוריון של העיר היא מקבלת המלצה לעבוד בבית הוצאה לאור המוזיקלי המכובד של שלמר, ובעקבות שרשרת של אירועים ברי מזל, ובעיקר בגלל שהיא פנויה לעבודה, היא מקבלת את הזדמנות לעבוד כמעתיקה לצד האמן הגדול ביותר שחי - לודוויג ואן בטהובן (אד האריס). שלמר יודע שבטהובן הרגזן לא ישמח, בלשון המעטה, לעבוד עם אישה, אבל אין לו ברירה אלא לשכור אותה. אנה רואה בכך הזדמנות מאלוהים להראות למלחין המפורסם את עבודתה והיא מסכימה בהתלהבות. בטהובן הסקפטי מנסה להכשיל את הצעירה ומציב לה אתגר מוזיקאלי, בו היא מפגינה את יכולותיה ואת התובנה המוזיקלית שלה. המאסטרו מקבל אותה לעבודה כמעתיקה, וכך מתחילה מערכת יחסים מיוחדת שתשנה את חיי השניים. במפגשים הראשונים שלהם, כשהוא לומד על השאיפות המקצועיות של אנה, בטהובן מנסה לדכא את התלהבותה של הסטודנטית הצעירה, אך אנה אינה נרתעת, ובאומץ חודרת לממלכתו המרתקת של בטהובן - דבר אשר ישנה באופן משמעותי את גורלה ואת מהותה. "להעתיק את בטהובן" מתרכז בשנים האחרונות בחייו של בטהובן, תקופה רבת תהפוכות בה נאבק בחירשותו, בדידותו ובטראומה משפחתית, תקופה שסיפקה השראה לסימפוניה הגדולה ביותר שכתבה אי פעם - התשיעית המדהימה.