ג'י איי ג'ו, יחידת מובחרת של הצבא, היא יחידת העלית, בעלת האומץ והגבורה, המשימה שלה היא להלחם בחיילי הרוע השטני של הקוברה, אירגון מחתרתי אשר פועל ליצור DNA רעיל במיוחד, בשיתוף עם בני האדם, בכדי ליצר צבא שלם של פרשי גייסות, אשר לא ניתן יהיה לעצור אותו בגלל הרעל האכזרי שהוא מפיק. בהנגתו של דוקי, ודוטי הכבד, והאדמוני, ועיני נחש, יחידת ג'י איי ג'ו האצילה, יוצאת למלחמה להציל את כל האנושות כולה.