חייל קומנדו בגמלאות חייב לעצור שייח ערמומי ואת חיילי הנינג'ה שלו מלבצע מתקפה גרעינית. כאשר שישה סוכנים אמריקאים ואחות נשבים ע"י טרוריסטים המתכננים לתקוף מטרה אמריקאית, ג'ו ארמסטרונג (מייקל דודיקוף), הוא הוא הנינג'ה האמריקאי, עושה דרכו לערבות אפריקה כדי להצילם.