כאשר סופרמן מחליט סוף סוף לגלות ללואיס ליין את זהותו ורגשותיו האמיתיים כלפיה, ברייניאק מחשב-העל מופיע, כשמטרתו היא להשתלט על העולם ביחד עם לקס לותר שמחפש בנקמה. מחומש בנשקים חדשים וקריפטון מיוחד בתוך גופו, ברייניאק הופך לאויב החזק והמסוכן ביותר של איש הפלדה. כאשר לואיס ליין נפצעת אנושות כתוצאה מפגיעה מקרן לייזר תועה של ברייאניק, יוצא סופרמן במירוץ כנגד הזמן לאיזור הפנטום כדי למצוא את התרופה לאהובתו. כעת כשברייניאק סבור כי סופרמן חוסל סופית, הוא יוצא למתקפה על מטרופוליס ועל כדור הארץ כולו. האם יצליח סופרמן לשרוד את איזור הפנטום על מנת להציל את אהובתו ואת העיר מטרופוליס?